Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms