Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ccdc36Q6PDM4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc36Q6PDM4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc36Q6PDM4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc36Q6PDM4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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