Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms