Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpdc1Q6NZK8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms