Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf9bQ6NZA9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms