Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rprd2Q6NXI6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms