Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CltbQ6IRU5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms