Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt77Q6IFZ6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt77Q6IFZ6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms