Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt39Q6IFX4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms