Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms