Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms