Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms