Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca2Q6DIC0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Smarca2Q6DIC0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms