Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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