Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pram1Q6BCL1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pram1Q6BCL1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms