Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms