Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sptbn2Q68FG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms