Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9aQ68FE2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms