Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fnip1Q68FD7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fnip1Q68FD7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms