Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp9bQ66X22 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrp9bQ66X22 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms