Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col4a5Q63ZW6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col4a5Q63ZW6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col4a5Q63ZW6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a5Q63ZW6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a5Q63ZW6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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