Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp4Q62445 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms