Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpaQ62189 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms