Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ttf1Q62187 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf1Q62187 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ttf1Q62187 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ttf1Q62187 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ttf1Q62187 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ttf1Q62187 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms