Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SspnQ62147 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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SspnQ62147 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SspnQ62147 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SspnQ62147 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SspnQ62147 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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