Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms