Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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