Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd47Q61735 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms