Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf4bQ61136 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms