Protein–RNA interactions for Protein: Q61115

Ptch1, Protein patched homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch1Q61115 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptch1Q61115 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ptch1Q61115 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptch1Q61115 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptch1Q61115 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms