Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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