Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd3Q61060 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms