Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms