Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelnQ60841 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RelnQ60841 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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RelnQ60841 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RelnQ60841 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelnQ60841 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelnQ60841 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelnQ60841 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms