Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms