Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rasa3Q60790 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa3Q60790 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms