Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms