Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a1Q60714 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a1Q60714 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc27a1Q60714 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc27a1Q60714 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a1Q60714 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc27a1Q60714 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms