Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms