Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms