Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp18Q5SSI6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms