Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zzef1Q5SSH7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zzef1Q5SSH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms