Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms