Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms