Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CoblQ5NBX1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms