Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zfp36l3Q5ISE2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp36l3Q5ISE2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms