Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DroshaQ5HZJ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms