Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms