Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syce1lQ5D525 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1lQ5D525 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms