Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Spag9Q58A65 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spag9Q58A65 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Spag9Q58A65 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spag9Q58A65 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Spag9Q58A65 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Spag9Q58A65 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spag9Q58A65 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms